Мы завершили обновление платформы и перешли на AlmaLinux 9.6. В связи с этим хотели бы обратить ваше внимание на несколько изменений:

1. Новые очереди для HybriLIT и Govorun;
2. Система модулей Lmod используется вместо Modules;
3. Изменились домашние директории пользователей:
   • /zfs/store5.hydra.local/user/l/login — домашняя директория пользователя, предназначенная для редактирования файлов, сборки и компиляции программ.
   • /lustre/projects/l/login — директория пользователя для проведения расчетов, хранения и обработки данных.
4. Рекомендуемый порядок работ на платформе описан здесь.

Также сообщаем, что в настоящее время продолжается копирование файлов из предыдущего хранилища в вашу текущую директорию /lustre/projects. Этот процесс может занять некоторое время. Просим не беспокоиться — все ваши данные сохранены и будут полностью перенесены. Кроме того, на платформе установлены обновленные версии прикладных программных пакетов.

Рекомендуемые шаги работы на платформе HybriLIT

Типичный рабочий процесс на платформе состоит из нескольких шагов:

1. подключение к кластеру,
2. подготовка файлов в домашней директории,
3. копирование данных в файловую систему проектов для вычислений,
4. запуск задач через SLURM
5. сохранение результатов

Шаги работы

1. Подключение к платформе
   Подключение к кластеру осуществляется по SSH:
   ssh hydra.jinr.ru -l <login>

   
   После входа вы окажетесь в вашей домашней директории.

2. Работа в домашней директории (HOME, ZFS)
   Путь: /zfs/store5.hydra.local/user/l/login/

   Назначение:
   Домашняя директория предназначена для:
   • редактирования исходных файлов
   • сборки и компиляции программ
   • хранения конфигурационных файлов
   • подготовки скриптов для запуска задач
   Квота: 100 GB

3. Загрузка программного обеспечения через Lmod
   На платформе используется система модулей Lmod для управления программным обеспечением.
   
   Просмотреть доступные программы: module avail
   Просмотреть загруженные модули: module list
   
   Загрузить модуль: module load <module_name>

   
   Пример:
   module load gcc
module load openmpi

   
   После загрузки необходимых модулей вы можете компилировать программы или подготавливать окружение для запуска задач. 

4. Копирование файлов в файловую систему проектов (PROJECTS, Lustre)
   Перед запуском вычислений рекомендуется копировать данные и скрипты в файловую систему проектов: /lustre/projects/l/login/
   
   Назначение: Данная файловая система предназначена для:
   • входных данных задач
   • промежуточных файлов
   • результатов вычислений
   Она оптимизирована для параллельного ввода-вывода и работы вычислительных задач.
   Квота: Для пользователей квота не установлена.

   
   Пример копирования файлов: cp input.dat /lustre/projects/l/login/
   

5. Запуск задачи через SLURM
   Для запуска вычислений необходимо подготовить job-скрипт SLURM и отправить задачу в очередь. 
   
   Отправка задачи: sbatch job.sh

   
   Планировщик SLURM распределит задачу на вычислительные узлы кластера.
   

6. Получение результатов
   После завершения задачи в рабочей директории появится файл вывода: slurm-<jobid>.out

   
   Также все файлы, созданные вашей программой, будут находиться в директории проекта.

7. Копирование результатов обратно в HOME
   Важные результаты рекомендуется копировать обратно в домашнюю директорию для хранения или дальнейшей обработки:
   cp results.dat /zfs/store5.hydra.local/user/l/login/